Na jej funkcjonowanie zgodzić musiały się oczywiście władze niemieckie. Początkowo Szkoła miała początkowo cztery Wydziały: Budownictwa z oddziałami Komunikacyjno-Wodnym i Konstrukcyjno-Budowlanym; Elektryczny z oddziałami Telekomunikacyjnym i Elektrycznym; Budowy Maszyn z oddziałami Konstrukcyjnym i Technologicznym oraz Chemii Technicznej. Jesienią 1942 r. uruchomiono dodatkowo Wydział Mierniczy.

Prawie cała kadra PWST składała się z byłych pracowników Politechniki Warszawskiej, a zajęcia odbywały się w uczelnianych salach wykładowych. PWST zakończyła funkcjonowanie wraz z wybuchem Powstania Warszawskiego. W czasie działania Szkoły dyplom inżynierski uzyskało tam 186 osób.