Transkryptomika przestrzenna mapuje ekspresję genów w tkankach, co stwarza wyzwanie w zakresie określenia przestrzennego rozmieszczenia różnych typów komórek. Jednak plamy transkryptomiki przestrzennej zawierają wiele komórek. Dlatego obserwowany sygnał pochodzi z mieszanin komórek różnych typów. W tym miejscu proponujemy innowacyjny model probabilistyczny Celloskop, który wykorzystuje ustaloną wcześniejszą wiedzę na temat genów markerowych dekonwolucji typu komórki z danych transkryptomiki przestrzennej. Celloskop przewyższa inne metody na symulowanych danych, skutecznie wskazuje znane struktury mózgu i przestrzennie rozróżnia typy neuronów hamujących i pobudzających w tkance mózgowej myszy, a także analizuje dużą niejednorodność składu nacieków immunologicznych w tkance gruczołu krokowego.