Applied Molecular-Based Quality Control of Biobanked Samples for Multi-Omics Approach
Niniejsze badanie podkreśla znaczenie zapewnienia jakości w ośrodkach biobankowania, szczególnie w kontekście badań o wysokiej wydajności i nowych technik molekularnych. Stworzyliśmy specyficzne procesy zarządzania jakością wykorzystujące biopróbki pobrane od pacjentów onkologicznych w polskich klinikach. Proces dla próbek surowicy/osocza obejmował istotne etapy, takie jak monitorowanie hemolizy, kontrolowanie ekstrakcji RNA, ocenę jakości i ilości biblioteki cDNA oraz ocenę surowych danych NGS przed analizą bioinformatyczną. Ocena patologiczna świeżo zamrożonych próbek tkanek została przeprowadzona w celu weryfikacji obrazów histologicznych i określenia zawartości guza. W związku z tym opracowaliśmy przepływy pracy do przedanalitycznej kontroli jakości próbek surowicy/osocza i świeżo mrożonych tkanek, które można dostosować do indywidualnych możliwości biobanku. Te zintegrowane molekularne metody kontroli jakości zapewniają, że procedury biobankowania spełniają wymagania wysokowydajnych testów, oferując dostęp do próbek biologicznych o potwierdzonej jakości omicznej. Zdecydowanie zalecamy wdrożenie tych przepływów pracy w celu kwalifikacji próbek przed przeprowadzeniem testów multi-omicznych, ponieważ wykazują one wyjątkową czułość i specyficzność.
Artykuł:
Cancers
Autorzy z PW:
Przemysław Biecek
Dyscyplina:
Rok wydania: