Przejdź do treści

Publikacje

Wartość? 200 punktów

Publikacje to nieodłączna część pracy naukowców. To publikacje opisują i podsumowują dorobek badawczy, często wielomiesięczny albo nawet wieloletni wysiłek, budują pozycję naukowców i całych zespołów. Są także elementem ewaluacji – oceny konkretów osób, a co za tym udzie – całych dyscyplin.

Na poniższej liście prezentujemy najwyżej punktowane publikacje (czyli takie za 200 punktów), w które wkład mieli naukowcy z Politechniki Warszawskiej. Wykaz obejmuje dane od początku 2023 roku.

Cloud-native distributed genomic pileup operations

To prezentacja skalowalnej, rozproszonej i wydajnej implementacji algorytmu gromadzenia danych, która nadaje się do wdrożenia w środowiskach obliczeniowych w chmurze. Autorzy zaimplementowali własny algorytm partycjonowania danych zoptymalizowany do pracy z sekwencjami, nowatorskie i unikalne podejście do przetwarzania zdarzeń sekwencjonowania z wykorzystaniem tagów MD, mikrooptymalizacje kodu źródłowego dla operacji cyklicznych oraz modularną strukturę algorytmu. Udowodnili, że nowatorskie podejście konsekwentnie i znacząco przewyższa inne zaawansowane rozproszone narzędzia pod względem czasu wykonania (do 6,5 raza szybciej) i użycia pamięci (do 2 razy mniej), co prowadzi do znaczącej redukcji kosztów w chmurze. 

Artykuł:

Bioinformatics

Rok wydania:

Autorzy z PW:

Marek Wiewiórka, Agnieszka Szmurło, Paweł Stankiewicz, Tomasz Gambin