Przejdź do treści

Publikacje

Wartość? 200 punktów

Publikacje to nieodłączna część pracy naukowców. To publikacje opisują i podsumowują dorobek badawczy, często wielomiesięczny albo nawet wieloletni wysiłek, budują pozycję naukowców i całych zespołów. Są także elementem ewaluacji – oceny konkretów osób, a co za tym udzie – całych dyscyplin.

Na poniższej liście prezentujemy najwyżej punktowane publikacje (czyli takie za 200 punktów), w które wkład mieli naukowcy z Politechniki Warszawskiej. Wykaz obejmuje dane od początku 2023 roku.

Polyphenolic compounds affect the long-term degradation behaviour of polymer and composite materials based on PCL, PLGA, and bioactive glass

W ostatnich latach modyfikacja biodegradowalnych poliesterów alifatycznych za pomocą bioaktywnych ceramik i substancji czynnych pochodzenia roślinnego zdobyła dużą uwagę w zastosowaniach biomedycznych. Zapewniają one znaczną poprawę biologicznej funkcjonalności syntetycznych polimerów. Jednak równocześnie wpływają na wiele właściwości fizykochemicznych. W tej pracy po raz pierwszy oceniono wpływ wprowadzenia polifenoli (PPh) wyodrębnionych z szałwii oraz cząsteczek bioaktywnego szkła otrzymywanego metodą sol-gel, zarówno samodzielnie, jak i w kombinacji, do poli(ε-kaprolaktonu) (PCL) i poli(kwasu mlekowego-kwasu glikolowego) (PLGA). Nasze wyniki podkreślają ważność uwzględniania wpływu powszechnie stosowanych modyfikatorów polimerowych na jedną z najważniejszych właściwości biomateriałów stosowanych w inżynierii tkankowej i dostarczaniu leków - degradację.

Artykuł:

Sustainable Materials and Technologies

Rok wydania:

Autorzy z PW:

Emilia Choińska

In vitro and in vivo degradation behavior of Mg-0.45Zn-0.45Ca (ZX00) screws for orthopedic applications

Stopy magnezu (Mg) stały się potencjalnym materiałem do stosowania w implantach ortopedycznych ze względu na brak konieczności usuwania implantu, biokompatybilność i integralność mechaniczną do momentu zagojenia złamania. W ramach badania przeprowadzono analizę degradacji in vitro i in vivo śruby do mocowania z Mg o składzie Mg-0,45Zn-0,45Ca (ZX00, w mas.%). Wyniki z badań in vivo wykazały, że stop ZX00 wspomaga gojenie kości i tworzenie nowej tkanki kostnej w bezpośrednim kontakcie z produktami korozyjnymi. Ponadto zaobserwowano tę samą kompozycję chemiczną produktów korozyjnych zarówno w badaniach in vitro, jak i in vivo; jednak rozkład pierwiastków i grubość różniły się w zależności od lokalizacji implantu. Nasze wyniki sugerują,  że stop ZX00 jest odpowiednią stopem magnezowym do stosowania w czasowych implantach kostnych, a  odporność na korozję zależała od mikrostruktury.

Artykuł:

Bioactive Materials

Rok wydania:

Autorzy z PW:

Diana Clemencia Martinez Guerrero, Anna Dobkowska, Jakub Jaroszewicz, Tomasz Płociński, Wojciech Święszkowski

Synergistic strategy constructed novel double-network scaffolds with active micro-environment pH stabilization and M2-macrophage polarization for cartilage defect repair

Ze względu na zaburzenia w mikrośrodowisku pH, utrzymujące się zapalenie i niekompletną funkcjonalność strukturalną zrostu chrząstki-kostnej, naprawa defektów chrząstki stała się poważnym problemem. Dlatego obiecującym podejściem do leczenia defektów chrząstki jest stworzenie wielofunkcyjnej sztucznej chrząstki zdolnej do stabilizacji pH w mikrośrodowisku, redukcji zapalenia i promowania utrzymania integralności strukturalnej w stawie. W tym celu stworzono sztuczną chrząstkę (M-APUs) składającą się z poliuretanu na bazie aminokwasów i zmodyfikowanego chitozanu. Sztuczna chrząstka została zweryfikowana na modelu zwierzęcym, a wyniki pokazały, że M-APUs mogą zapobiec pogorszeniu się chrząstki stawowej i wspomagać jej naprawę. Ponadto histologiczny wynik ICRS naprawionej chrząstki wzrósł znacząco, a integralność struktury i funkcjonalność stawu zostały znacznie poprawione.

Artykuł:

Composites Part B-Engineering

Rok wydania:

Autorzy z PW:

Emilia Choińska

Magnesium implant degradation provides immunomodulatory and proangiogenic effects and attenuates peri-implant fibrosis in soft tissues

Implanty wykonane z magnezu (Mg) są coraz częściej stosowane u pacjentów w celu osiągnięcia osteosyntezy, jednocześnie degradując się wewnątrz. Ponieważ implanty Mg i Mg2+ zostały sugerowane jako posiadające właściwości przeciwzapalne, klinicznie obserwowane zapalenie tkanek miękkich wokół implantów Mg jest enigmatyczne. W tym badaniu, przy użyciu modelu tkanek miękkich szczura i okresu obserwacji od 1 do 28 dni, określono czasowo-przestrzenny rozkład komórek i ich zachowanie w związku z sekwencyjnymi zmianami właściwości powierzchni implantu z czystego Mg i uwalnianiem Mg2+. Morfologicznie wykazano zwiększoną angiogenezę, poprzedzoną wysokim wyrażeniem czynnika wzrostu śródbłonka naczyniowego. Przejście do właściwej naprawy tkanek zbiegało się z wzbogaceniem powierzchni implantu w Ca i P oraz zmniejszeniem stężenia Mg2+ wokół implantu. Implanty Mg wykazywały cieńszą otoczkę włóknistą w porównaniu do Ti. Szczegółowe zrozumienie związku między właściwościami materiału Mg, a procesami komórkowymi z określonym czasem i przestrzenią stanowi podstawę do interpretacji obserwacji klinicznych i przyszłego dostosowywania implantów Mg.

Artykuł:

Bioactive Materials

Rok wydania:

Autorzy z PW:

Diana Clemencia Martinez Guerrero, Tomasz Płociński, Wojciech Święszkowski

3D-GNOME 3.0: a three-dimensional genome modelling engine for analysing changes of promoter-enhancer contacts in the human genome

Publikacja opisuje zaktualizowaną wersję silnika modelowania genomu trójwymiarowego do analizy zmian kontaktów między promotorem a wzmacniaczem w ludzkim genomie. W bieżącej wersji dodano funkcję analizowania zmian odległości przestrzennych między promotormi a wzmacniaczami w zespołach modeli chromatyny 3D, zaktualizowano zbiory danych o nowatorskie pętle chromatyny CTCF i RNAPII ChIA-PET uzyskane z linii komórkowej GM12878 zmapowanej do montażu genomowego GRCh38 oraz rozszerzono zbiór danych 1000 Genomes SVs. Szereg zastosowanych rozwiązań przyniósł przyspieszenie o 30 razy i poprawę wizualizacji i analizy danych. Efekty pracy można bezpłatnie oglądać na serwerze 3D-GNOME 3.0, który dostarcza unikalnych spostrzeżeń dotyczących mechanizmu topologicznego wariacji ludzkich na skalę populacyjną z dużym przyspieszeniem. 

Artykuł:

Nucleic Acids Research

Rok wydania:

Autorzy z PW:

Michał Własnowolski, Michał Kadlof, Kaustav Sengupta, Dariusz Plewczyński

Cloud-native distributed genomic pileup operations

To prezentacja skalowalnej, rozproszonej i wydajnej implementacji algorytmu gromadzenia danych, która nadaje się do wdrożenia w środowiskach obliczeniowych w chmurze. Autorzy zaimplementowali własny algorytm partycjonowania danych zoptymalizowany do pracy z sekwencjami, nowatorskie i unikalne podejście do przetwarzania zdarzeń sekwencjonowania z wykorzystaniem tagów MD, mikrooptymalizacje kodu źródłowego dla operacji cyklicznych oraz modularną strukturę algorytmu. Udowodnili, że nowatorskie podejście konsekwentnie i znacząco przewyższa inne zaawansowane rozproszone narzędzia pod względem czasu wykonania (do 6,5 raza szybciej) i użycia pamięci (do 2 razy mniej), co prowadzi do znaczącej redukcji kosztów w chmurze. 

Artykuł:

Bioinformatics

Rok wydania:

Autorzy z PW:

Marek Wiewiórka, Agnieszka Szmurło, Paweł Stankiewicz, Tomasz Gambin